Таблица 1. Идентификация программой PepNovo+ пептида QKQELDELSTNIR и пептидов, полученных в результате его деградации по Эдману. Красным цветом выделены остатки, идентифицируемые по разнице масс пептидов. (последовательность QKQE с N-конца пептида). Числа – остаточная масса за вычетом массы известных аминокислотных остатков до данной позиции.
Peptid | MH+ (Da) | res. 1 | res. 2 | res. 3 | res. 4 | res. 5 | res. 6 | res. 7 | res. 8 | res. 9 | res. 10 | res. 11 | res. 12 | res. 13 |
P1 | 1626.73 | 52.91 | 180.97 | 309.07 | E | L | D | E | L | S | T | N | L | R |
P2 | 1626.73 | 52.91 | 180.97 | 309.07 | 437.13 | L | D | E | L | S | T | N | L | R |
P3 | 1626.73 | 52.91 | 180.97 | 309.06 | 437.12 | 566.17 | D | E | L | S | T | N | L | R |
P4 | 1573.82 | Q | K | Q | E | L | D | E | L | S | T | N | L | R |
P5 | 1573.81 | -0.003 | 128.06 | Q | E | L | D | E | L | S | 402.25 | 288.21 | 175.12 | 19.02 |
P6 | 1573.82 | -0.003 | 128.06 | Q | E | L | D | E | L | S | T | N | L | R |
P7 | 1445.76 | K | Q | E | L | D | E | L | 503.29 | 402.24 | 288.2 | 175.12 | 19.01 | |
P8 | 1445.76 | K | Q | E | L | D | E | L | S | 402.24 | 288.2 | 175.12 | 19.01 | |
P9 | 1445.77 | K | Q | E | L | D | E | L | S | T | 288.21 | 175.12 | 19.02 | |
P10 | 1445.76 | K | Q | E | L | D | E | L | S | T | N | L | R | |
P11 | 1317.62 | Q | E | L | D | E | L | S | 401.79 | 287.75 | 174.66 | 18.56 | ||
P12 | 1189.61 | E | L | D | E | L | S | T | 288.21 | 175.12 | 19.02 | |||
P13 | 1060.56 | L | D | E | L | S | T | N | 175.12 | 19.02 | ||||
P14 | 1047.6 | -12.962 | 102.07 | E | L | S | T | N | L | R |