Таблица 1. Конфигурации виртуальных машин для обработки данных, полученных с использованием ONT. vCPU – виртуальный центральный процессор, GPU – графический со-процессор компании NVidia.
Конфигурация |
Выполняемая операция |
Количество процессоров и ядер |
Объем памяти, |
Стоимость, $/час
|
|
vCPUxCores |
GPUxType |
||||
p3.8хlarge |
«бейз-коллинг» |
32x16 |
4xV100 |
259 856 |
15.29 |
p3.2xlarge* |
8x4 |
1xV100 |
62 464 |
3.82 |
|
p2.xlarge |
картирование/ квантификация/ контроль качества |
4x2 |
1xK80 |
12 288 |
1.32 |
t2.xlarge |
4x4 |
Нет |
32 768 |
0.42 |
|
t2.micro |
загрузка/ выгрузка данных |
1 |
Нет |
1 024 |
0.01 |
Примечание. Для быстрого ознакомления с работой облачной системы с тестовыми данными (пред-загружены на сервер AWS MrFirst (ONT) в папку fast5.tutor) все операции рекомендуется выполнять с использованием конфигурации p3.2xlarge. Сведения для авторизации доступа к AWS MrFirst (ONT) предоставляются по запросу авторами статьи.