Таблица 4. Примеры превышение полученных оценок 3D сходства для различных соединений в сравнении с оценками 3D сходства для одинаковых соединений.
|
Оценка 3D сходства для одинаковых соединений |
Mol ID |
Similarity |
3D Similarity |
2D Similarity |
Target Name/MoA |
Target ID |
Activity |
Compound name |
|
61.50% |
ICV10 |
34.98 |
73.29% |
47.73% |
virus: 3C-like protease |
P0DTD1 |
SARS 3CL(IC50=63ВµM) |
C25H22FN4O4 |
|
78.90% |
ICV193 |
15.56 |
80.71% |
19.28% |
virus: 3C-like protease |
P0DTD1 |
SARS 3CL(IC50=11.2ВµM) |
Tideglusib |
|
78.90% |
ICV305 |
16.38 |
85.55% |
19.15% |
virus: Papain-like protease |
P0DTD1 |
SARS PL(IC50=46.1ВµM) |
Tideglusib |
|
60.58% |
ICV139 |
13.42 |
68.83% |
19.50% |
virus: 3C-like protease |
P0DTD1 |
SARS 3CL(IC50=5.52ВµM) |
Remdesivir |
|
60.58% |
ICV118 |
14.63 |
68.64% |
21.32% |
virus: 3C-like protease |
P0DTD1 |
SARS 3CL(Ki=6.7ВµM) |
Remdesivir |
|
60.58% |
ICV412 |
15.83 |
67.92% |
23.30% |
human: Calcium channel |
- |
MERS(IC=2.36ВµM) Vero |
Remdesivir |
|
60.58% |
ICV428 |
15.2 |
63.10% |
24.09% |
human: Eukaryotic initiation factor 4A-I |
P60842 |
MERS(EC50=3nM) MRC-5 cell; HCoV-229E(EC50=1.3nM) MRC-5 cell |
Remdesivir |
|
60.58% |
ICV392 |
18.23 |
62.17% |
29.32% |
virus: Helicase |
P0DTD1 |
SARS Helicase(IC50=5.4ВµM) |
Remdesivir |
Примечание. «Mol ID» - идентификатор соединения, представленного в базе данных CoViLigands, с которым сравнивалось исследуемое соединение; «3D Similarity» – оценка сходства трёхмерных структур; «2D Similarity» – оценка сходства двумерных структур; «Similarity» - произведение оценок двумерного и трёхмерного сходства; «Target name/MoA» - название белка-мишени или механизма действия; «Activity» - данные об активности соединения из CoViLigands.