Таблица 1. Белки, кодируемые генами хромосомы 18 человека, идентифицированные в контрольных и обработанных SDS образцах кератиноцитов человека HaCaT.

п/п

Идентификатор

Название белка

Ген

Валидированные уникальные пептиды

Количество Пептидов

Молекулярная масса, кДa

Кратность изменения контроль/SDS

 

Нормированный спектральный количественный фактор (Spectrum Counting NSAF)

Биологический процесс (заболевание)

Контроль

SDS

Контроль

 

SDS

 

Контроль

SDS

1

P25705

ATP synthase subunit alpha, mitochondrial (ATPA_HUMAN)

ATP5F1A

4

4

36

31

59.7

1.6

0.201

0.126

митохондриальный синтез ATP, ионный транспорт, негативная регуляция пролиферации эндотелиальных клеток (синдром Лея, синдром MELAS)

2

P36952

Serpin B5 (SPB5_HUMAN)

SERPINB5

10

11

25

23

42.1

1

0.207

0.207

регуляция пролиферации эпителиальных клеток, опухолевый супрессор.

3

P05120

Plasminogen activator inhibitor 2 (PAI2_HUMAN)

SERPINB2

14

9

16

11

46.6

1.4

0.140

0.103

заживление ран, фибринолиз, отрицательная регуляция апоптоза

4

Q9UIV8

Serpin B13 (SPB13_HUMAN)

 SERPINB13

н.о.

13

н.о.

13

44.2

-

н.о.

0.129

отрицательная регуляция апоптотического процесса кератиноцитов, регуляция дифференцировки кератиноцитов и протеолиза, ответ на УФ

5

P29508

Serpin B3 (SPB3_HUMAN)

SERPINB3

н.о.

1

н.о.

12

44.5

-

н.о.

0.080

процесс позитивной регуляции пролиферации клеточной популяции, регулирует активность эндопептидаз (гепатокарцинома)

6

Q96EE3

Nucleoporin SEH1 (SEH1_HUMAN)

SEH1L

11

7

12

8

39.6

1.9

0.083

0.045

необходим для нормального прикрепления микротрубочек кинетохор, митотической прогрессии и сегрегации хромосом

7

O43776

Asparagine--tRNA ligase, cytoplasmic (SYNC_HUMAN)

NARS

8

11

12

15

62.9

0.6

0.047

0.083

аминоацилирование тРНК

8

P18621

60S ribosomal protein L17 (RL17_HUMAN)

RPL17

1

1

8

8

21.4

1.2

0.214

0.186

трансляция, структурная составляющая рибосомы

9

P32926

Desmoglein-3 (DSG3_HUMAN)

DSG3

8

4

10

7

107. 5

2

0.016

0.008

клеточная адгезия, кератинизация

10

P48594

Serpin B4 (SPB4_HUMAN)

SERPINB4

2

4

9

12

44.8

1

0.056

0.059

может действовать как ингибитор протеазы, модулируя иммунный ответ хозяина против опухолевых клеток

11

O00194

Ras-related protein Rab-27B (RB27B_HUMAN)

RAB27B

3

4

7

7

24.6

0.6

0.037

0.059

регулирование гомеостаза позднего пути эндоцитоза, включая эндосомное позиционирование, созревание и секрецию

12

Q9Y4W6

AFG3-like protein 2 (AFG32_HUMAN)

AFG3L2

7

4

7

6

88.5

2

0.016

0.008

требуется для созревания  параплегина (SPG7) после его расщепления митохондриально-процессирующей пептидазой (MPP) и для созревания PINK1

13

P22830

Ferrochelatase, mitochondrial (HEMH_HUMAN)

FECH

7

1

7

5

47.8

10

0.027

0.003

катализирует введение железа в протопорфирин IX

14

Q96FV9

THO complex subunit 1 (THOC1_HUMAN)

THOC1

н.о.

1

н.о.

2

75.7

-

н.о.

0.002

участвует в пути апоптоза, который характеризуется активацией каспазы-6, увеличением экспрессии BAK1 и BCL2L1 и активацией NF-κB.

15

O14950

Myosin regulatory light chain 12B (ML12B_HUMAN)

MYL12B

2

2

6

6

19.8

0.7

0.087

0.120

регуляция сокращения мышц и немышечных клеток посредством фосфорилирования, цитокинез

16

Q96KP4

Cytosolic non-specific dipeptidase (CNDP2_HUMAN)

CNDP2

2

1

8

8

52.8

0.7

0.024

0.036

процесс биосинтеза глутатиона, функциональный супрессор опухолей при раке желудка через активацию митоген-активируемой протеинкиназы

17

Q14126

Desmoglein-2

(DSG2_HUMAN)

DSG2

7

2

10

4

122.2

3.5

0.010

0.003

ороговение, клеточная адгезия (аутоиммунные буллезные дерматозы, такие как обыкновенная пузырчатка)

18

O43396

Thioredoxin-like protein 1 (TXNL1_HUMAN)

TXNL1

4

6

5

6

32.2

0.6

0.031

0.048

клеточный окислительно-восстановительный гомеостаз

19

Q9P0L0

Vesicle-associated membrane protein-associated protein A (VAPA_HUMAN)

VAPA

1

2

11

7

27.9

2.1

0.172

0.081

биосинтез сфинголипидов, клеточная гибель, регуляция липидного транспорта и мембранный синтез в эндоплазматическом ретикулуме

20

P49257

Protein ERGIC-53 (LMAN1_HUMAN)

LMAN1

16

17

19

20

57.5

0.8

0.129

0.155

транспорт белков из эндоплазматического ретикулума в аппарат Гольджи, свертывание крови (комбинированный дефицит факторов свертывания крови V и VIII)

21

P23368

NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial (MAOM_HUMAN)

ME2

2

2

18

16

65.4

0.9

0.060

0.070

метаболизм малата и пирувата, цикл трикарбоновых кислот

22

P19404

NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 2, mitochondrial (NDUV2_HUMAN)

NDUFV2

8

6

8

6

27. 4

1.9

0.135

0.073

оксидоредуктаза участвует в электронном транспорте и дыхательной цепи

23

O75351

Vacuolar protein sorting-associated protein 4B (VPS4B_HUMAN)

VPS4B

1

4

4

5

49.3

0.1

0.003

0.028

участвует в пролиферации клеток, в регуляции сборки митотического веретена на разных стадиях клеточного деления (рак кожи)

24

Q9UBB5

Methyl-CpG-binding domain protein 2 (MBD2_HUMAN)

MBD2

3

1

4

3

43.2

2

0.022

0.011

репрессор транскрипции, играет роль в подавлении генов

25

P62314

Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 (SMD1_HUMAN)

SNRPD1

5

4

5

5

13.3

1.5

0.277

0.181

играет роль в сплайсинге мРНК

26

Q06136

3-ketodihydrosphingosine reductase (KDSR_HUMAN)

KDSR

2

2

8

7

36.2

0.9

0.127

0.138

оксидоредуктаза, участвующая в биосинтезе сфинголипидов (эритрокератодермия, генодерматоз)

27

P00167

Cytochrome b5 (CYB5_HUMAN)

CYB5A

1

1

5

5

15.3

1.1

0.205

0.193

окислительно-восстановительные процессы, транспорт электронов

28

P54578

Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 14 (UBP14_HUMAN)

USP14

2

2

3

3

56.0

1

0.005

0.005

служит физиологическим ингибитором деградации, связанной с эндоплазматическим ретикулумом, в условиях отсутствия стресса

29

Q9BVV7

Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim21 (TIM21_HUMAN)

TIMM21

2

1

2

1

28.2

2

0.010

0.005

транспорт  транзитных белков  через внутреннюю мембрану митохондрий

30

Q96P63

Serpin B12 (SPB12_HUMAN)

 SERPINB12

3

н.о.

4

н.о.

46.3

-

0.009

н.о.

ингибитор протеаз, трипсина и плазмина

31

Q9Y5U9

Immediate early response 3-interacting protein 1 (IR3IP_HUMAN)

IER3IP1

2

н.о.

2

н.о.

8.9

-

0.040

н.о.

участвует в регуляции апоптоза,

 в транспорте белка между эндоплазматическим ретикулумом и аппаратом Гольджи

32

Q14574

Desmocollin-3 (DSC3_HUMAN)

DSC3

2

н.о.

4

н.о.

99.9

-

0.003

н.о.

процесс межклеточной адгезии

33

Q96ND0

Protein FAM210A (F210A_HUMAN)

FAM210A

2

н.о.

2

н.о.

30.8

-

0.009

н.о.

нуклеоплазма, митохондрии и аппарат Гольджи

34

Q13636

Ras-related protein Rab-31 (RAB31_HUMAN)

RAB31

1

н.о.

1

н.о.

21.6

-

0.012

н.о.

ключевой регулятор внутриклеточного мембранного транспорта

35

Q02413

Desmoglein-1 (DSG1_HUMAN)

DSG1

1

н.о.

4

н.о.

113.7

-

0.007

н.о.

процесс межклеточной адгезии

36

Q8N4Q0

Prostaglandin reductase 3 (PTGR3_HUMAN)

ZADH2

1

3

4

5

40.1

0.6

0.019

0.030

отрицательная регуляция дифференцировки клеток адипоцитов, пероксисома

37

Q9BY50

Signal peptidase complex catalytic subunit SEC11C (SC11C_HUMAN)

SEC11C

1

н.о.

2

н.о.

21.5

-

0.006

н.о.

удаляет сигнальные пептиды из возникающих белков по мере их перемещения в просвет эндоплазматического ретикулума

38

Q08554

Desmocollin-1 (DSC1_HUMAN)

DSC1

1

н.о.

1

н.о.

99.9

-

0.002

н.о.

процесс межклеточной адгезии, ороговение 

Примечание.н.о. - не обнаружен