Таблица 1. Описание 25 наборов данных масс-спектрометрических экспериментов, использованных в работе.
ID в работе [7] |
Всего уникальных пептидов |
UP |
FR |
ПТМ-1 |
Идентификатор PRIDE |
Химическая метка |
Диапозон pH |
S2 |
13223 |
3022 |
69 |
6496 |
PXD000065 |
- |
4.4-4.65 |
S3 |
28079 |
4364 |
72 |
12113 |
PXD000065 |
- |
3.7-4.9 |
S4 |
26417 |
4799 |
72 |
10973 |
PXD000065 |
- |
3.7-4.9 |
S5 |
17849 |
3299 |
72 |
8228 |
PXD000065 |
- |
4.0-4.25 |
S6 |
17114 |
3427 |
72 |
8314 |
PXD000065 |
- |
4.2-4.45 |
S7 |
18154 |
2754 |
72 |
7867 |
PXD000065 |
- |
3.7-4.05 |
S8 |
23594 |
1456 |
54 |
9887 |
PXD0006291 |
TMT10 |
3.0-10.0 |
S9 |
32843 |
2448 |
72 |
12521 |
PXD0006291 |
TMT10 |
3.7-4.9 |
S10 |
28428 |
2073 |
49 |
12088 |
PXD006291 |
TMT10 |
3.0-10.0 |
S11 |
18042 |
1626 |
72 |
7779 |
PXD006291 |
TMT10 |
3.7-4.9 |
S12 |
10922 |
415 |
24 |
4227 |
PXD010006 |
TMT10 |
3.0-10.0 |
S13 |
720 |
86 |
3 |
238 |
PXD010006 |
TMT10 |
2.5-3.7 |
S14 |
38161 |
2935 |
46 |
17293 |
PXD010006 |
TMT10 |
3.0-10.0 |
S15 |
12473 |
367 |
22 |
5520 |
PXD005410 |
TMT10 |
3.0-10.0 |
S16 |
61651 |
3784 |
65 |
29439 |
PXD005410 |
TMT10 |
3.0-10.0 |
S17 |
3821 |
74 |
9 |
1565 |
PXD005410 |
TMT10 |
2.5-3.7 |
S18 |
11238 |
83 |
72* |
4925 |
PXD000065 |
iTRAQ8 |
3.7-4.9 |
S19 |
2679 |
172 |
18 |
996 |
PXD017201 |
TMT10 |
3.0-10.0 |
S20 |
2692 |
157 |
16 |
897 |
PXD017201 |
TMT10 |
3.0-10.0 |
S21 |
2787 |
186 |
18 |
973 |
PXD017201 |
TMT10 |
3.0-10.0 |
S22 |
2847 |
185 |
19 |
929 |
PXD017201 |
TMT10 |
3.0-10.0 |
S23 |
2686 |
159 |
16 |
933 |
PXD017201 |
TMT10 |
3.0-10.0 |
S24 |
24129 |
1637 |
31 |
10957 |
PXD006291 |
TMT10 |
6.0-9.0 |
S25 |
30125 |
2317 |
42 |
13612 |
PXD006291 |
TMT10 |
6.0-11.0 |
[13] |
26473 |
16419 |
18 |
7595 |
PXD018450 |
- |
- |
Примечание. UP – число немодифицированных пептидов, по которым возможен пересчёт RT в virtual HI; FR - число фракций в выборке, для которых было достаточно данных для пересчёта, * - все фракции рассматривались как единственная; ПТМ-1 – число пептидов с одной единственной ПТМ.