Table 3. Calculated binding free energies using MM–PBSA for complex HSP90 with compounds 19 and 21.
Complex |
Energy contribution (kcal/mol) |
||||
ΔEele |
ΔEvdw |
ΔGp |
ΔGnp |
ΔEtotal
|
|
HSP90-19 |
-22.68 |
-35.89 |
37.31 |
-5.10 |
-26.35
|
HSP90-21 |
-26.93 |
-31.75 |
36.26 |
-4.56 |
-26.97
|
Примечание. ΔEvdw - энергия сил Ван-дер Вальса; ΔEele – энергия электростатического взаимодействия; ΔGp – энергия сольватации полярной поверхности; ΔGnp - энергия сольватации неполярной поверхности