Таблица 1. Праймеры, используемые при ПЦР амплификаци для получения экзонов (ex-1, ex-2, ex-3, ex-4, ex-6, ex-7 и ex-8+ex-9) транскриционного варианта-2 мРНК гена реналазы крысы (Rattus norvegicus)./p>

экзона

Обозначениe

праймеров

Структура праймера(5' → 3')

Размер праймера

(нуклеотиды)

ex-1

1RR-for

atgggtcgcGGATCCatgttccgggtactggtggtg

36

ex-1

1RR-rev

ctatgtccccagccttgtcc

20

ex-2

2RR-for

ggacaaggctgggga cat agggggaagaatgactactgc

40

ex-3

2RR-rev

ttttggtgctttttggc

23

ex-3

3RR-for

gccaaaaagcaccaaaatttttagaggagcttttagctc

40

ex-3

3RR-rev

ctgattctttcaagtagtacttg

23

ex-4

4RR-for

caagtactacttgaaagaatcaggtgctgaagtcttcc

38

ex-4

4RR-rev

agttcacaatgtcaccttg

22

ex-6

6RR-for

caaggtgacattgtgaacttaattagtgaacgccagaggc

40

ex-6

6RR-rev

ctgtgttgcgcttcttactg

20

ex-7

7RR-for

cagtaagaagcgcaacacagagtcatcagaatgtggcccattgc

44

ex-7

7RR-rev

ctgtgaatatctccacttcc

20

ex-8

8RR-for

ggaagtggagatattcacaggttacaaactcagctgccaac

43

ex-8 и

ex-9

8-9RR-rev

agctgtccaCTCGAGtcagatgtatatcaggaaagggttgag

42

Примечание. В структуре прямых (RR-for) праймеров (нуклеотиды выделены курсивом и жирным шрифтом) обозначена область перекрывания соседних экзонов. Праймеры 1Re-for и 8-9Re-rev включают сайты рестрикции BamHI и XhoI, соответственно (нуклеотиды обозначены заглавной буквой). Праймер 8-9Re-revсодержит н.п. (15 нуклеотидов) 8 экзона, нуклеотидную последовательности 9-го экзона (9 нуклеотидов), терминирующий кодон (tca - выделены жирным шрифтом и подчеркнут) и сайт рестрикции XhoI (CTCGAG)