Таблица 1. Праймеры, используемые при ПЦР амплификаци для получения экзонов (ex-1, ex-2, ex-3, ex-4, ex-6, ex-7 и ex-8+ex-9) транскриционного варианта-2 мРНК гена реналазы крысы (Rattus norvegicus)./p>
№ экзона |
Обозначениe праймеров |
Структура праймера(5' → 3') |
Размер праймера (нуклеотиды) |
ex-1 |
1RR-for |
atgggtcgcGGATCCatgttccgggtactggtggtg |
36 |
ex-1 |
1RR-rev |
ctatgtccccagccttgtcc |
20 |
ex-2 |
2RR-for |
ggacaaggctgggga cat agggggaagaatgactactgc |
40 |
ex-3 |
2RR-rev |
ttttggtgctttttggc |
23 |
ex-3 |
3RR-for |
gccaaaaagcaccaaaatttttagaggagcttttagctc |
40 |
ex-3 |
3RR-rev |
ctgattctttcaagtagtacttg |
23 |
ex-4 |
4RR-for |
caagtactacttgaaagaatcaggtgctgaagtcttcc |
38 |
ex-4 |
4RR-rev |
agttcacaatgtcaccttg |
22 |
ex-6 |
6RR-for |
caaggtgacattgtgaacttaattagtgaacgccagaggc |
40 |
ex-6 |
6RR-rev |
ctgtgttgcgcttcttactg |
20 |
ex-7 |
7RR-for |
cagtaagaagcgcaacacagagtcatcagaatgtggcccattgc |
44 |
ex-7 |
7RR-rev |
ctgtgaatatctccacttcc |
20 |
ex-8 |
8RR-for |
ggaagtggagatattcacaggttacaaactcagctgccaac |
43 |
ex-8 и ex-9 |
8-9RR-rev |
agctgtccaCTCGAGtcagatgtatatcaggaaagggttgag |
42 |
Примечание. В структуре прямых (RR-for) праймеров (нуклеотиды выделены курсивом и жирным шрифтом) обозначена область перекрывания соседних экзонов. Праймеры 1Re-for и 8-9Re-rev включают сайты рестрикции BamHI и XhoI, соответственно (нуклеотиды обозначены заглавной буквой). Праймер 8-9Re-revсодержит н.п. (15 нуклеотидов) 8 экзона, нуклеотидную последовательности 9-го экзона (9 нуклеотидов), терминирующий кодон (tca - выделены жирным шрифтом и подчеркнут) и сайт рестрикции XhoI (CTCGAG)