Таблица 1. Число пептидов, полученных в ходе виртуального расщепления трипсином, которые теоретически могут совпасть с «эталонным» набором для разных биологических видов.
|
Биологический вид |
Число пептидов*, совпадающих с "эталонным" набором |
Общее число пептидов*, полученных в результате виртуального гидролиза |
% |
|
Homo sapiens |
96552 |
416076 |
23.2% |
|
Chlorocebus sabaeus |
72635 |
391986 |
18.5% |
|
Mus musculus |
56196 |
366333 |
15.3% |
|
Rattus norvegicus |
23576 |
158195 |
14.9% |
|
Escherichia coli |
4465 |
53324 |
8.4% |
|
Arabidopsis thaliana |
581 |
277458 |
0.2% |
Примечание. Данная таблица показывает потенциальное число пептидов, которые могут быть детектированы при ЖХ-МС/МС анализе и какое количество пептидов может совпасть с «эталонным» набором. *Без учёта модифицированных пептидов, «недорезов» и возможной неспецифичности гидролиза. Размер пептидов от 9 до 50 аминокислотных остатков.