Biomedical Chemistry: Research and Methods 2022, 5(1), e00164

Исследование чувствительности к протеолизу полноразмерной и укороченной форм рекомбинантной реналазы человека, экспрессированных в прокариотической системе

В.И. Федченко*, А.А. Калошин, С.А. Калошина, А.Т. Копылов, А.Е. Медведев

Научно-исследовательский институт биомедицинской химии имени В.Н. Ореховича, 119121 Москва, Погодинская ул., 10; * e-mail: valfed38@yandex.ru

Ключевые слова: реналаза, трипсин, протеолиз

DOI: 10.18097/BMCRM00164

ВВЕДЕНИЕ

RNLS — недавно открытый многофункциональный белок [1], играющий разные роли внутри и снаружи клеток. Внутри клеток полноразмерная RNLS действует как FAD-зависимая оксидоредуктаза, катализирующая окисление никотинамидных коферментов, образующихся при неспецифическом восстановлении β-NAD(P)+ [2]. Секреция RNLS во внеклеточное пространство сопровождается удалением N-концевого пептида, который необходим для размещения кофактора FAD, поэтому внеклеточная укороченная RNLS (truncated RNLS, tRNLS) не может осуществлять FAD-зависимые функции [3]. Считают, что внеклеточные RNLS проявляют различные защитные эффекты посредством неферментативных механизмов [4]. Механизмы действия внеклеточной RNLS остаются предметом активного изучения [4-7]. Следует отметить, что ряд синтетических пептидов, воспроизводящих некоторые аминокислотные фрагменты последовательности RNLS, проявляют биологическую активность в модельных клеточных системах, свойственную полноразмерной рекомбинантной RNLS [6]. Если принять во внимание наши данные об отсутствии протеотипического пептида RNLS (100-116 аминокислотные остатки (а.о.) последовательности) в плазме крови [8], это свидетельствует в пользу того, что внеклеточная RNLS подвергается дальнейшему протеолитическому процессингу, а биологические эффекты, приписываемые этому белку, обусловлены действием образовавшихся пептидов.

Целью данной работы было изучение чувствительности полноразмерной RNLS и укороченной tRNLS к действию трипсина.

МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ

Реагенты

В работе использовали реактивы производства «Sigma-Aldrich» (США), а также белковые маркеры молекулярной массы PageRuler™ PrestainedProteinLadder от 2 кДа до 250 кДа производства «Bio-Rad» (США). Полноразмерная рекомбинантная реналаза человека (RNLS) [910] и рекомбинантная реналаза человека, лишенная N-концевого сигнального пептида (tRNLS) [11], были получены в прокариотической системе в виде белков, содержащих С-концевую гексагистидиновую метку (рис. 1), при помощи которой эти белки были очищены на Ni-агарозе [91112]. Масс спектрометрический анализ рекомбинантной полноразмерной RNLS, экспрессированной в такой системе, выявил присутствие кофактора FAD в препарате этого белка (неопубликованные данные).

Рисунок 1. Две формы реналазы, использованные в данной работе.
SP – сигнальный пептид.

Индивидуальные поликлональные антитела овцы были получены против антигена полноразмерной человеческой рекомбинантной RNLS человека и очищены в «Покард» (Россия). Моноклональные антикроличьи/овечьи IgG-антитела, конъюгированные с пероксидазой хрена, были приобретены в «ИМТЭК» (Россия).

Протеолиз рекомбинантной реналазы трипсином

Протеолиз рекомбинантных реналаз (RNLS, tRNLS) человека трипсином проводили в объеме 20 мкл с добавление 0.2 мкг реналазы в трипсиновом буфере («Sigma-Aldrich»), содержащем 1 ед. или 0.01 ед. трипсина. После инкубации в течение 30 мин при 37°С реакцию останавливали нагреванием при 90°С в течение 5 мин, а реакционную смесь использовали для электрофореза в 12% полиакриламидном геле (ПААГ) в присутствии SDS (SDS-PAGE).

Электрофорез

Электрофорез проводили в 12% полиакриламидном геле (ПААГ) в присутствии SDS в системе Лэммли [13].

Вестерн-блоттинг

Вестерн-блоттинг проводили по стандартному протоколу, описанному в [14], с небольшими модификациями, описанными в [9]. После блоттинга нитроцеллюлозные мембраны иммуноокрашивали хромогенным субстратом 3,3'-диаминобензидином с использованием первичных антител овцы против RNLS и моноклональных антител IgG против кролика/овцы, конъюгированных с пероксидазой хрена.

РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ

Для изучения возможной протеолитической деградации реналаз в крови человека мы исследовали действия трипсина на две формы реналаз (RNLS, tRNLS). Первая форма - рекомбинантная форма реналазы (RNLS) была получена нами ранее [910]. Она включает в себя N-концевой сигнальный пептид (1-17 а.о.), отвечающий за секрецию реналазы из клеток и участвующий в формировании т.н. укладки Россмана (2-35 а.о.), необходимой для «размещения» кофактора FAD (3-42 а.о.), и С-концевой гистидиновый остаток 6хHis(8 а.о.), необходимый для выделения белка с помощью Ni-аффинной хроматографии [12] (рис. 1). Вторая полученная нами форма реналазы лишена N-концевого сигнального пептида (1-17 а.о.) (tRNLS) [11] (рис. 1).

Инкубация препаратов очищенных рекомбинантных реналаз человека (RNLS и tRNLS) с трипсином (1 ед.) приводит полному исчезновению этих белков на электрофореграмме и иммуноблоте (рис. 2; ср. дорожки 2 и 4, 3 и 5). При снижении концентрации трипсина в среде инкубации на два порядка (0.01 ед.) полноразмерная RNLS демонстрировала большую устойчивость к действию этой протеазы, в то время как tRNLS практически полностью подвергалась расщеплению (рис. 3; ср. дорожки 2 и 4, 3 и 5).

Рисунок 2. SDS-PAGE электрофорез (а) и Вестерн-блот анализ (b) двух форм рекомбинантных реналаз человека, инкубированных в присутствии 1 ед. трипсина. (1) — маркеры молекулярных масс, (2) — 0.2 мкг RNLS,
(3) — 0.2 мкг tRNLS, (4) — 0.2 мкг RNLS инкубация с 1 ед. трипсина,
(5) — 0.2 мкг tRNLS инкубация с 1 ед. трипсина.

Рисунок 3. SDS-PAGE электрофорез (а) и Вестерн-блот анализ (b) двух форм рекомбинантных реналаз человека, инкубированных в присутствии 0.01 ед. трипсина. (1) маркеры молекулярных масс, (2) — 0.2 мкг RNLS, (3) — 0.2 мкг tRNLS, (4) — 0.2 мкг RNLS инкубация с 0.01 ед. трипсина, (5) — 0.2 мкг tRNLS инкубация с 0.01 ед. трипсина.

Мы предполагаем, что различная чувствительность RNLS и tRNLS к действию низкой концентрации трипсина, по-видимому, определяется присутствием кофактора FAD в полноразмерном рекомбинантном белке, который способствует формированию пространственной структуры, более устойчивой к действию некоторых протеаз.

СОБЛЮДЕНИЕ ЭТИЧЕСКИХ СТАНДАРТОВ

Данная работа не содержит каких-либо исследований с использованием людей и животных в качестве объектов исследования.

ФИНАНСИРОВАНИЕ

Исследования выполнены в рамках проекта РФФИ №20–015–00104.

КОНФЛИКТ ИНТЕРЕСОВ

Авторы заявляют об отсутствии конфликта интересов.

ЛИТЕРАТУРА

  1. Xu, J., Li G., Wang, P., Velazquez, H., Yao, X., Li, Y., Wu, Y., Peixoto, A., Crowley, S., Desir, G.V. (2005) Renalase is a novel, soluble monoamine oxidase that regulates cardiac function and blood pressure, J. Clin. Invest., 115, 1275-1280. DOI
  2. Moran, G.R., Hoag, M.R. (2017) The enzyme: Renalase, Arch Biochem Biophys., 632, 66-76. DOI
  3. Fedchenko, V., Kopylov, A., Kozlova, N., Buneeva, O., Kaloshin, A., Zgoda, V., Medvedev, A. (2016) Renalase secreted by human kidney НЕК293Т cells lacks its N-terminal peptide: implications for putative mechanisms of renalase action. Kidney Blood Pressure Research, 41, 593-603
  4. Pointer, T.C., Gorelick, F.S., Desir, G.V. (2021) Renalase: A Multi-Functional Signaling Molecule with Roles in Gastrointestinal Disease, Cells, 10, 2006. DOI
  5. Kolodecik, T.R., Reed, A.M., Date, K., Shugrue, C.A., Patel, V., Chung, S.L., Desir, G.V., Gorelick, F.S. (2017) The serum protein renalase reduces injury in experimental pancreatitis. J. Biol. Chem., 292, 21047-21059. DOI
  6. Wang, L., Velazquez, H., Chang, J., Safirstein, R., Desir, G.V. (2015) Identification of a receptor for extracellular renalase.PLoS One. 10, e0122932. DOI
  7. Wang, Y., Safirstein, R., Velazquez, H., Guo, X.J., Hollander, L., Chang, J., Chen, T.M., Mu, J.J., Desir, G.V.(2017) Extracellular renalase protects cells and organs by outside-in signalling. J. Cell. Mol. Med., 21, 1260-1265. DOI
  8. Medvedev, A., Kopylov, A., Fedchenko, V., Buneeva, O. (2020) Is renalase ready to become a biomarker of ischemia? Int. J. Cardiol. 307, 179. DOI
  9. Fedchenko, V. I., Kaloshin, A.A., Mezhevikina, L.M., Buneeva, O.A., Medvedev, A.E. (2013) Construction of the coding sequence of the transcription variant 2 of the human renalase gene and its expression in the prokaryotic system. Int. J. Mol. Sci. 14, 12764-12779. DOI
  10. Fedchenko, V.I., Kaloshin, A.A. (2019) A simplified method for obtaining cDNA of low-copy and silent eukaryotic genes using human renalase as anexample. Biomedical Chemistry: Research and Methods. 2(2), e00101. DOI
  11. Fedchenko, V.I., Kaloshin, A.A., Kozlova, N.I., Kopylov, A.T., Medvedev, A.E.(2020) Construction of a chimeric human gene encoding renalase with a modified N-terminus. Biomedical Chemistry: Research and Methods, 3(3), e00137. DOI
  12. Fedchenko, V.I., Kaloshin, A.A., Kaloshina,, S.A, Medvedev, A.E.(2021) Expression and isolation of N-terminal truncated human recombinant renalasein prokaryotic cells. Biomedical Chemistry: Research and Methods , 4, e00158 DOI
  13. Laemmli, U.K. (1970) Cleavage of structural proteins during the assemblyof the head of bacteriophage T4. Nature; 227, 680-685. DOI
  14. Gallagher, S., Winston, ,S.E., Fuller, S.A., Hurrell, J.G.R. (2011) Immunoblotting and immunodetection. Curr.Protoc. Cell Biol. 52, 6.2.1-6.2.28. DOI