Ингибирование активности каспазы-2 в клетках Т-клеточной лимфомы человека Jurkat при помощи переключающего сплайсинг олигонуклеотида к её пре-мРНК

##plugins.themes.bootstrap3.article.main##

Д.Д. Жданов
А.А. Плясова
Ю.А. Гладилина
М.В. Покровская
С.С. Александрова
Н.Н. Соколов

Аннотация

Каспаза-2 является ферментом, участвующим в индукции апоптоза. Количество активного фермента каспазы-2 регулируется альтернативным сплайсингом (АС) её мРНК. Целью данной работы было определение способности олигонуклеотида, комплементарного пре-мРНК Casp-2, индуцировать АС. Данный олигонуклеотид блокировал связывание регулирующих сплайсинг белков со своими сайтами на конце экзона 9 пре-мРНК Casp-2, что приводило к индукции АС мРНК Casp-2: понижению экспрессии полноразмерного активного сплайс-варианта Casp-2L и повышению экспрессии укороченного варанта Casp-2S в клетках Т-клеточной лимфомы человека линии Jurkat. При этом уровень экспрессии общей Casp-2 не изменялся. Нарушуение пропорции сплайс-вариантов Casp-2 приводил к ингибированию ферментативной активности каспазы-2.

##plugins.themes.bootstrap3.article.details##

Как цитировать
Жданов D., Плясова A., Гладилина Y., Покровская M., Александрова S., & Соколов N. (2019). Ингибирование активности каспазы-2 в клетках Т-клеточной лимфомы человека Jurkat при помощи переключающего сплайсинг олигонуклеотида к её пре-мРНК. Biomedical Chemistry: Research and Methods, 2(3), e00108. https://doi.org/10.18097/BMCRM00108
Раздел
ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ

Библиографические ссылки

  1. Bao, Q., Shi, Y. (2007) Apoptosome: a platform for the activation of initiator caspases. Cell Death and Differentiation, 14(1), 56–65. DOI
  2. Vakifahmetoglu-Norberg, H., Zhivotovsky, B. (2010) The unpredictable caspase-2: what can it do? Trends in Cell Biology, 20(3), 150–159. DOI
  3. Wotawa, A., Solier, S., Logette, E., Solary, E., Corcos, L. (2002) Differential influence of etoposide on two caspase-2 mRNA isoforms in leukemic cells. Cancer Letters, 185(2), 181–189. DOI
  4. Aravind, L., Dixit, V.M., Koonin, E.V. (1999) The domains of death: evolution of the apoptosis machinery. Trends in Biochemical Sciences, 24(2), 47–53. DOI
  5. Zhivotovsky, B., Orrenius, S. (2005) Caspase-2 function in response to DNA damage. Biochemical and Biophysical Research Communications, 331(3), 859–867. DOI
  6. Wang, L., Miura, M., Bergeron, L., Zhu, H., Yuan, J. (1994) Ich-1, an Ice/ced-3-related gene, encodes both positive and negative regulators of programmed cell death. Cell, 78(5), 739–750. DOI
  7. Kumar, S., Kinoshita, M., Noda, M. (1997) Characterization of a mammalian cell death gene Nedd2. Leukemia, 11(3), 385–386. DOI
  8. Lavrik, I.N., Golks, A., Baumann, S., Krammer, P.H. (2006) Caspase-2 is activated at the CD95 death-inducing signaling complex in the course of CD95-induced apoptosis. Blood, 108(2), 559–565. DOI
  9. Jiang, Z.H., Zhang, W.J., Rao, Y., Wu, J.Y. (1998) Regulation of Ich-1 pre-mRNA alternative splicing and apoptosis by mammalian splicing factors. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 95(16), 9155–9160. DOI
  10. Côté, J., Dupuis, S., Wu, J.Y. (2001) Polypyrimidine track-binding protein binding downstream of caspase-2 alternative exon 9 represses its inclusion. Journal of Biological Chemistry, 276(11), 8535–8543. DOI
  11. Havlioglu, N., Wang, J., Fushimi, K., Vibranovski, M.D., Kan, Z., Gish, W., Wu, J.Y. (2007) An intronic signal for alternative splicing in the human genome. PloS one, 2(11), e1246. DOI
  12. Fushimi, K., Ray, P., Kar, A., Wang, L., Sutherland, L.C., Wu, J.Y. (2008) Up-regulation of the proapoptotic caspase 2 splicing isoform by a candidate tumor suppressor, RBM5. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 105(41), 15708–15713. DOI
  13. Rocha, C.S.J. (2019) Antisense Oligonucleotides for Splice Modulation: Assessing Splice Switching Efficacy. Methods Mol. Biol. 2036, 73–90. DOI
  14. Zhdanov, D.D., Gladilina, Y.A., Grishin, D.V., Pokrovsky, V.S., Pokrovskaya, M.V., Aleksandrova, S. S., Sokolov, N. N. (2018) Apoptotic Endonuclease EndoG Induces Alternative Splicing of Telomerase TERT Catalytic Subunit, Caspase-2, DNase I, and BCL-x in Human, Murine, and Rat CD4+T Lymphocytes. Russian Journal of Bioorganic Chemistry, 44(1), 90–103. DOI
  15. Zhdanov, D.D., Vasina, D.A., Orlova, V.S., Gotovtseva, V.Y., Bibikova, M. V., Pokrovsky, V.S., Sokolov, N.N. (2016) Apoptotic endonuclease EndoG induces alternative splicing of telomerase catalytic subunit hTERT and death of tumor cells. Biochemistry (Moscow) Supplement Series B: Biomedical Chemistry, 10(4), 310–321. DOI
  16. Zhdanov, D.D., Gladilina, Y.A., Pokrovsky, V.S., Grishin, D.V., Grachev, V.A., Orlova, V.S., Sokolov, N.N. (2019) Endonuclease G modulates the alternative splicing of deoxyribonuclease 1 mRNA in human CD4+ T lymphocytes and prevents the progression of apoptosis. Biochimie, 157, 158–176. DOI
  17. Baker, B.F., Lot, S.S., Condon, T.P., Cheng-Flournoy, S., Lesnik, E.A., Sasmor, H.M., Bennett, C. F. (1997) 2’-O-(2-Methoxy)ethyl-modified anti-intercellular adhesion molecule 1 (ICAM-1) oligonucleotides selectively increase the ICAM-1 mRNA level and inhibit formation of the ICAM-1 translation initiation complex in human umbilical vein endothelial cells. Journal of Biological Chemistry, 272(18), 11994–12000. DOI
  18. Rigo, F., Seth, P.P., Bennett, C.F. (2014) Antisense oligonucleotide-based therapies for diseases caused by pre-mRNA processing defects. Advances in Experimental Medicine and Biology, 825, 303–352. DOI
  19. Havens, M.A., Hastings, M.L. (2016) Splice-switching antisense oligonucleotides as therapeutic drugs. Nucleic Acids Research, 44(14), 6549–6563. DOI