Высокопроизводительный скрининг с помощью оптического SPR-биосенсора низкомолекулярных соединений на взаимодействие с CYP51 Candida krusei
##plugins.themes.bootstrap3.article.main##
Аннотация
Условно-патогенный гриб Candida krusei (C. krusei) является возбудителем нозокомиальных инфекций, характеризующихся высокой летальностью. В последнее время наблюдается тенденция к увеличению доли штаммов дрожжевых грибов, резистентных к препаратам класса азолов. Поэтому поиск потенциальных противогрибковых соединений неазольной природы является актуальным направлением исследований при разработке новых эффективных терапевтических средств в отношении резистентных штаммов грибов. Ланостерол 14-альфа деметилаза (CYP51) является широко известной мишенью для противогрибковых средств. Оптические SPR-биосенсоры представляют собой универсальный инструмент для скрининговых исследований, целью которых является поиск прототипов новых лекарственных соединений. В данной работе представлены методические аспекты высокопроизводительного скрининга библиотеки низкомолекулярных соединений природного происхождения, направленного на установление их взаимодействия с CYP51 C. krusei с использованием SPR-биосенсора. Как показывают результаты, при проведении высокопроизводительного скрининга особое внимание следует обращать на степень выраженности наклона сенсограммы взаимодействия в фазе ассоциации. Описанные подходы к анализу данных высокопроизводительного скрининга могут быть полезны исследователям, работающим с SPR-биосенсорами различных моделей.
##plugins.themes.bootstrap3.article.details##
Библиографические ссылки
- Mastromarino P., Vitali B., Mosca L. (2013) Bacterial vaginosis: a review on clinical trials with probiotics. New Microbiol., 36(3), 229-238.
- Forastiero A., Garcia-Gil V., Rivero-Menendez O., Garcia-Rubio R., Monteiro M.C., Alastruey-Izquierdo A., Jordan R., Agorio I., Mellado E. (2015) Rapid development of Candida krusei echinocandin resistance during caspofungin therapy. Antimicrob. Agents Chemother., 59(11), 6975-6982. DOI
- Choi H.K., Jeong S.J., Lee H.S., Chin B.S., Choi S.H., Han S.H., Kim M.S., Kim C.O., Choi J.Y., Song Y.G., Kim J.M. (2009) Blood stream infections by Candida glabrata and Candida krusei: a single-center experience. Korean J. Intern. Med., 24(3):263-269. DOI
- Pfaller M.A., Diekema D.J., Gibbs D.L., Newell V.A., Nagy E., Dobiasova S., Rinaldi M., Barton R., Veselov A. (2008) Global antifungal surveillance group. Candida krusei, a multidrug-resistant opportunistic fungal pathogen: geographic and temporal trends from the ARTEMIS DISK Antifungal Surveillance Program, 2001 to 2005. J. Clin. Microbiol., 46(2), 515-21. DOI
- Zhang J., Li L., Lv Q., Yan L., Wang Y., Jiang Y. (2019) The fungal CYP51s: their functions, structures, related drug resistance, and inhibitors. Front Microbiol., 10, 691. DOI
- Hou X., Sun M., Bao T., Xie X., Wei F., Wang S. (2020) Recent advances in screening active components from natural products based on bioaffinity techniques. Acta Pharm. Sin B., 10(10), 1800-1813. DOI
- Strushkevich N., Usanov S.A., Park H.W. (2010) Structural basis of human CYP51 inhibition by antifungal azoles. J. Mol. Biol., 397(4), 1067-1078. DOI
- Kaluzhskiy L., Ershov P., Shkel T., Gnedenko O., Ivanchina N., Strushkevich N., Kicha A., Grabovec I., Gilep A., Usanov S., Stonik V., Ivanov A. (2018). Application of the SPR biosensor in drug prototypes discovery with human cytochrome P450(51) as an example. Biomedical Chemistry: Research and Methods, 1(4), e00055. DOI
- Johnsson B., Löfås S., Lindquist G. (1991) Immobilization of proteins to a carboxymethyldextran-modified gold surface for biospecific interaction analysis in surface plasmon resonance sensors. Anal. Biochem., 198(2), 268-277. DOI
- Murray J.B., Roughley S.D., Matassova N., Brough P.A. (2014) Off-rate screening (ORS) by surface plasmon resonance. An efficient method to kinetically sample hit to lead chemical space from unpurified reaction products. J. Med. Chem., 57(7), 2845-2850. DOI