MOLTRA-II. Новые дескрипторы водородной связи

##plugins.themes.bootstrap3.article.sidebar##

pdf html html (English)
Опубликован: Sep 10, 2018
DOI: https://doi.org/10.18097/BMCRM00069
Ключевые слова:
3-D дескрипторы дескрипторы водородной связи

##plugins.themes.bootstrap3.article.main##

С.В. Трепалин
Институт физиологически активных веществ Российской академии наук, 142432, Черноголовка Московской обл., Северный проезд, 1
А.В. Ярков
Институт физиологически активных веществ Российской академии наук, 142432, Черноголовка Московской обл., Северный проезд, 1
О.А. Раевский
Институт физиологически активных веществ Российской академии наук, 142432, Черноголовка Московской обл., Северный проезд, 1

Аннотация

Программа MOLTRA-II, созданная на основе системы управления химическими базами данных CHED, дополнена возможностью расчёта новых дескрипторов на основе трёхмерной структуры и параметров водородной связи. Программа рассчитывает дескрипторы PSA (Polar Surface Area), OSA (Optimal Structure Area) и энергию водородной связи.

##plugins.themes.bootstrap3.article.details##

Как цитировать
Трепалин S., Ярков A., & Раевский O. (2018). MOLTRA-II. Новые дескрипторы водородной связи. Biomedical Chemistry: Research and Methods, 1(3), e00069. https://doi.org/10.18097/BMCRM00069
Выпуск
Том 1 № 3 (2018)
Раздел
ПРОТОКОЛЫ ЭКСПЕРИМЕНТОВ, ПОЛЕЗНЫЕ МОДЕЛИ, ПРОГРАММЫ И СЕРВИСЫ

Библиографические ссылки

  1. Raevsky, O.A., Grigoriev, V.Yu., Trepalin, S.V. (1999). HYBOT (Hydrogen Bond Thermodynamics). The certificate of official registration program for computer No. 990090.
  2. Trepalin, S.V., Yarkov, A.V., Razdolsky, A.N., Raevsky, O.A. (2014) MOLTRA-II. The new possibilities for calculation of molecular descriptors on the basis of inter atomic distances spectra. Modern high technologies, N12, 33-36.
  3. Trepalin, S.V., Yarkov, A.V. (2001). CheD: Chemical Database Compilation Tool, Internet Server, and client for SQL Servers. J. Chem. Inf. Comput. Sci., 41, 100-107. DOI
  4. Platts, J.A. (2000). Theoretical prediction of hydrogen bond basicity, Phys. Chem. Chem. Phys., 2 (14), 3115-3120. DOI
  5. Lamarche, O.,Platts, J.A. (2003). Complimentary nature of hydrogen bond basicity and acidity scale from electrostatic and atoms in molecules properties, Phys. Chem. Chem. Phys., 5 (4), 677-684. DOI
  6. Schwobel,J., Ebert,R.-U., Kuhne, R., Schuurmann, G. (2009). Prediction of intrinsic hydrogen bond acceptor strength of organic compounds by local molecular parameters, J. Chem. Inf. Model., 49(4), 956-962. DOI
  7. Hitchcock SA, Pennington LD (2006). Structure - Brain Exposure Relationships. J. Med. Chem. 49 (26): 7559–7583. DOI
  8. Raevsky, O.A., Skvortsov, V.S. (2005). Quantifying hydrogen bonding in QSAR and molecular modeling, SAR &QSAR in Enviromental Research, 16(3), 287-300. DOI
  9. Raevsky, O.A., Skvortsov, V.S. (2002). 3D hydrogen bond thermodynamics (HYBOT) potentials in molecular modelling, J.Comput. Aid Drug Design, 16(1), 1-10. DOI